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问:但后来一个公共的病毒序列数据库显示,中国研究人员于1月5日提交了第一个病毒序列。所以至少有3天时间,你肯定知道有一种新的冠状病毒。这个问题现在不会改变疫情的进程,但说实话,对疫情的公开报道受阻了吗。

作者们提到,2013年在中国云南采集的中华菊头蝠样本RaTG13和新冠病毒在核苷酸序列水平上相似性为96%。尽管存在这种序列相似性,但新冠病毒和RaTG13在许多关键的基因组特征上存在差异,其中最重要的一点是,新冠病毒包含了S蛋白S1和S2亚基交界处的一个多碱基(furin)酶切位点插入(PRRA残基)。

另一个备受关注的问题是,新冠病毒是否是重组病毒,这种重组是否可能促进了其出现。例如,有证据表明新冠病毒、RaTG13和广东穿山甲之间存在重组,而RmYN02的基因组也同样受到重组的广泛影响。

目前还没有详细的流行病学数据。我们从一开始就面临着一种非常疯狂和善于隐蔽的病毒。意大利、欧洲其他地方和美国也是如此:从一开始,科学家们就认为,“嗯,这只是一种病毒。”

问:关于此次疫情在中国的起源有很多问题。中国研究人员报告称,最早的病例可以追溯到2019年12月1日。但《南华早报》有一篇报道称,2019年11月出现病例,第一例发生在11月17日,这个你如何看待?

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另外,尽管冠状病毒的突变率可能比其他RNA病毒要低,但它们的长期核苷酸替换率与其他RNA病毒相同。这表明,较低的突变率在一定程度上由病毒在宿主体内的高复制率弥补了。

在此次疫情尚不为外界警觉时,即2019年12月26日,张永振、霍尔姆斯等人获得了武汉中心医院一名患者的病毒样本。1月5日凌晨,研究团队从样本中检测出一种新型SARS样冠状病毒,通过高通量测序获得了该病毒的全基因组序列(GenBank:MN908947),并立即报告了相关部门。1月11日,研究团队在病毒学网站(virological.org)发布了所获得的新型冠状病毒全基因组序列,系全球最早公布该病毒序列的团队。

如果不通过大规模的血清学调查,这些不确定性可能都无法解决,但当前数据很明显,COVID-19的病死率显著高于季节性流感,不过也低于两个密切相关的冠状病毒:2002年-2003年的SARS-CoV,以及自2015年以来一直存在(主要集中在阿拉伯半岛)的MERS-CoV。

一个非常重要的问题是,这种病毒在环境中的稳定性。因为它是一种包膜病毒,人们认为它很脆弱,对表面温度或湿度特别敏感。但从美国和中国的研究结果来看,病毒似乎在某些表面上非常抗破坏。它可能能在许多环境中生存,这个我们需要有科学的答案。